一、副交感神经
副交感神经主要来自迷走神经，在横结肠以下的结肠和直肠的副交感神经则来自盆神经。大多数节后神经纤维为胆碱能纤维，一部分副交感神经节后纤维为肽能纤维。一般来讲，胆碱能神经兴奋使胃肠运动增强，腺体分泌增加。
二、交感神经
交感神经来自脊髓胸5到腰3节段的侧角。节前纤维在腹腔神经节，肠系膜上、下神经节交换神经元后，发出节后纤维到胃、肠壁。一般来讲，交感神经的节后纤维为肾上腺素能纤维，交感神经兴奋对胃、肠运动和消化腺的分泌起抑制作用。
三、壁内神经丛
壁内神经丛包括位于纵行肌和环行肌层之间的肌间神经丛和位于黏膜下层的黏膜下神经丛。由许多神经元和短的神经纤维构成，可完成“局部反射”。
